Trpasličí planeta Pluto je díky své vzdálenosti zahalena mnoha tajemstvími, například o jejích 2 měsících Nix a Hydra se do roku 2002 vůbec nevědělo. Ještě tajemnější je atmosféra Pluta, o které toho astronomové vědí velmi málo. Na své 248 let dlouhé oběžné dráze kolem Slunce se Pluto přibližuje a vzdaluje centru sluneční soustavy, při přiblížení ke Slunci se atmosféra zvětšuje, při vzdálení naopak ztenčuje. Nejblíže Slunci bylo Pluto v roce 1989.
Poslední pozorování týmu britských vědců s pomocí teleskopu Jamese Clerka Maxwella na Havaji odhalila přítomnost oxidu uhelnatého v atmosféře, která je zřejmě mnohem tlustější než doposud myslelo, dosahuje až k téměř polovině vzdálenosti k měsíci Charon. Podle pozorování astronomů Pluto zřejmě při svém přiblížení ke Slunci dokonce ztrácí část horních vrstev atmosféry, které je odfouknutá slunečními větry. Pozorování pozemskými teleskopy nebo i pozorování vesmírným Hubblovým teleskopem, jsou ale nedostačující pro zkoumání tak vzdáleného objektu. Na cestě k okraji sluneční soustavy je však sonda NASA New Horizons, která by měla o plutoidu a jeho okolí získat odpovědi na některé z otázek. Pravděpodobně ale přinese ještě více otázek, protože až sonda New Horizons dorazí v roce 2015 k Plutu, nebude brzdit, ale proletí kolem něj obrovskou rychlostí a bude směřovat dál do Kuiperova pásu.